南陽醫專三附院眼科是南陽市特色專科、殘聯免費白內障手術定點中心、南陽市眼外傷急救基地、眼眶病與眼整形美容基地。由國內著名眼科專家廖樹森創建的醫專三附院眼科，先后引進德國蔡司眼科準分子激光、眼底激光、眼底熒光照影、眼前節激光、非接觸眼壓計、綜合驗光儀、OCT、美國博士倫新一代后段玻璃體切割系統、白內障超聲乳化儀、全自動電腦視野分析儀、眼電生理儀等先進設備，并建立了眼科實驗室。南陽醫專三附院眼科重點開展角膜潰瘍、角膜白斑的角膜移植手術，眼爆炸傷等復雜眼外傷，眼內異物取出術，整形術，復雜視網膜脫離球內、球外手術，眼底玻璃體積血手術治療，難治性青光眼閥植入術，白內障超聲乳化術，眼部微生物檢測技術等，致力于眼科醫技檢查研究。